Ciao, questo è un problema che ho rilevato anche io in passato ed a mia avviso è un problema di scheda audio integrata. Beh non proprio un problema, ma una bassa qualità nella programmazione del driver proprio; Non riescono a gestire correttamente i flussi da app esterne.
Come te, ho risolto utilizzando cuffie con microfono tramite usb invece che tramite jack.
Poi nelle impostazioni Opzioni Audio 3CX setti microfono su device usb e gestisci audio con Primary Sound Driver su "Sta suonando" e Autoparlanti su device usb. Uso queste impostazioni in modo che se suona il telefono e l'utente non ha indossato le cuffie, comunque un audio lo sente.
Buon lavoro.
Gianluca